İstanbul Teknik Üniversitesi Rektörlüğü ile Elginkan Vakfı arasında üniversitenin arazisinde bir arsayı tahsis etmesi, Elginkan Vakfı’nın da bu arsa üzerine bir lise binası yaptırıp üniversiteye bağışlaması konusunda 18 Haziran 2003 tarihinde bir protokol imzalanmıştır.
8 Mayıs 2004 tarihinde temel atma töreni yapılan İTÜ Ekrem Elginkan Lisesi'nin inşaatı 2005 yılı içerisinde tamamlanmıştır. Okul İTÜ'nün Ayazağa Yerleşkesinde, mevcut anaokulu ve ilköğretim okulunun yanında inşa edilmiştir. Projenin yatırım maliyeti, proje bedelleri, çevre düzenlemesi ve kontrollük hizmetleri KDV dâhil olmak üzere yaklaşık 5,7 Milyon TL mertebesinde gerçekleşmiştir.
5.266 m2kapalı alana sahip olan lise binasında; 16 adet derslik, 8 adet laboratuvar ve atölye, çok amaçlı salon, rehberlik ve kulüp odaları, yönetim ve servis bölümleri yer almaktadır. Okul ilk öğrencilerini Eylül 2005'te almıştır.
İTÜ Ekrem Elginkan Lisesi'nin 27.12.2005 tarihinde devir teslim işlemleri tamamlanarak, İTÜ Rektörlüğüne teslim edilmiştir.
